Les deux organisations sont nées à des moments différents (APQ en 1989; FPQ en 1997), dans des contextes particuliers, mais aussi avec des besoins très convergents.
Depuis avril 2005, les deux organisations se sont fusionnées sous le même nom d'Association des psychologues du Québec, afin de conjuguer leurs énergies et ainsi de mieux atteindre leurs objectifs.